会社で経理を担当していますが、実は長期間にわたり業務上横領を繰り返しています。会社も、最近になって横領に気付き、犯人特定のための調査を社内で進めている様子です。警察に自首をした方がよいでしょうか。

会社で経理を担当していますが、実は長期間にわたり業務上横領を繰り返しています。会社も、最近になって横領に気付き、犯人特定のための調査を社内で進めている様子です。警察に自首をした方がよいでしょうか。

ケースバイケースでしょう。会社が警察に事件相談済みの場合は、警察に自首をしても法律上の自首が成立しない可能性があります。
事件相談未了であれば、警察に自首する前に、会社に自主申告して謝罪・示談をすることにより、刑事事件化を防げる可能性もあります。
会社との示談が困難そうであれば、それでも示談の努力を継続しつつ、警察には事前に自首をしておくことも考えられます。
どうするのが最善かは、被害額その他の損害の大きさ、示談資金の準備状況、会社の処罰感情、会社との関係性、調査の進捗状況等によって事案毎に千差万別ですから、豊富な経験と専門的知識を持った弁護士に早めに相談すべきです。